Adalah alat yang terbuat dari kaca digunakan untuk mereaksikan bahan kimia dan menyimpan larutan kimia dalam volume sedikit. Tabung reaksi digunakan dalam analisis kualititatif, salah satunya untuk mengetahui ada tidaknya sulfat yang terkandung dalam air rembesan, air filter layer, dan air hujan Candi Borobudur. Cara yang dilakukan adalah mereaksikan air dengan barium klorida, bila terjadi endapan putih maka terdapat sulfat. Tabung reaksi juga digunakan untuk tempat menumbuhkan jamur pada batu Candi Borobudur maupun material cagar budaya lainnya.
SULING
Adalah alat bunyi-bunyian tiup berupa pipa. Suling berbentuk memanjang dengan sejumlah lubang pada permukaannya. Nada yang dihasilkan oleh suling diatur melalui mekanisme buka tutup lubang-lubang ini dengan jari tangan, sedangkan peniupan dilakukan pada salah satu bagian pangkal yang ujungnya tertutup. Pada relief Candi Borobudur terdapat penggambaran alat musik suling.
STORAGE

Merupakan gudang, tempat penyimpanan barang.
- Buffer storage = tempat penampungan
- Final storage = tempat penampungan akhir
Pada pemugaran kedua Candi Borobudur tahun 1973 – 1983, terdapat 3 tempat dimana batu Candi Borobudur transit setelah diturunkan dan sebelum dikembalikan ke tempatnya semula, yaitu :
- Buffer storage (tempat penampungan batu)
- Workshop (tempat pengerjaan batu)
- Final storage (tempat penampungan akhir)
Ketiga tempat tersebut terletak di sebelah barat daya candi.
STEREO PLOTTER FOTOGRAMMETRI
Merupakan hasil pemotretan (2 dimensi) dikembalikan menjadi keadaan aslinya (3 dimensi), untuk kemudian dilakukan penggambaran sesuai dengan keinginan.
STEREO MESS CAMERA
Adalah dikenal juga dikenal istilah stereometric camera dengan kemera ganda yang berfungsi sebagai alat fotogrametri analog yang dapat menghasilkan gambar tiga dimensi dari dua foto yang saling bertempelan. Hasil dari kamera ini adalah gambar yang tercetak pada negatif glass. Alat ini digunakan saat restorasi kedua Candi Borobudur dan sekarang disimpan di Studio Sejarah Restorasi Candi Borobudur.
STEAM CLEANER
Adalah alat atau mesin bertenaga listrik untuk memompa dan menyemburkan air untuk membersihkan bangunan candi yang tidak berelief di Candi Borobudur.
STATIF DAN KLEM
Adalah alat yang terbuat dari baja digunakan untuk menyangga buret. Statif dan klem digunakan untuk menyangga buret, sebagai pelengkap analisis kandungan kimiawi material Candi Borobudur dan cagar budaya lainnya.
SPEKTROFOTOMETRI SERAPAN ATOM (SSA)
Adalah alat yang digunakan untuk penentuan unsur-unsur logam dan metaloid pada sampel berdasarkan penyerapan absorbansi radiasi atom bebas. Teknik analisis SSA berdasarkan penguraian molekul menjadi atom (atomisasi) dengan energi dari api atau arus listrik.
Alat ini digunakan untuk menunjang salah satu kegiatan monitoring pelestarian Candi Borobudur dan lingkungannya yaitu menguji sampel air filter layer, air bak kontrol Candi Borobudur, air hujan di lingkungan Candi Borobudur, air sumur penduduk sekitar Candi Borobudur, dan air rembesan dinding Candi Borobudur. Adapun parameter yang diuji menggunakan SSA adalah kalsium, magnesium, besi, aluminium, dan timbal.
SPATULA = SENDOK SUNGU
Adalah alat yang terbuat dari kaca atau logam, digunakan untuk mengambil bahan kimia berbentuk serbuk. Spatula digunakan untuk mengambil bahan kimia maupun sampel endapan garam Candi Borobudur yang akan diuji komposisi kimiawinya.
SOUND LEVEL METER
Merupakan suatu alat yang digunakan untuk mengukur taraf intensitas suara/kebisingan yang ada di Candi Borobudur. Alat ini menampilkan data kebisingan dalam satuan desibel yang merupakan perbandingan dalam skala logaritma dari intesitas suara terukur dengan suatu nilai referensi (10-12 W/m2). Pengukuran kebisingan ini dilakukan ketika sedang dilaksanakan event yang menggunakan sound system besar di dekat Candi Borobudur sehingga bisa diketahui seberapa keras suara yang sampai ke candi.